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紅鰭東方鲀基因組微衛(wèi)星特征分析
對河豚基因組微衛(wèi)星分布特征進行研究,在約365Mb基因組序列中共找到49 647個微衛(wèi)星序列,平均每隔7 351個堿基就有1個.微衛(wèi)星序列長度主要分布在20～60個堿基的長度范圍內(nèi).全部微衛(wèi)星序列重復(fù)區(qū)長度(2 802 374bp)占整個基因組的比例為0.77%.兩堿基重復(fù)類型數(shù)目最多,為35 339個,占總數(shù)的71.30%;其次是四堿基類型,6 837個,占13.77%;再次分別是三堿基類型3 548個,占7.14%,五堿基類型1 856個,占3.73%,六堿基類型1 605個,占3.23%,單堿基類型最少,共402個,占0.80%.按降序排列,出現(xiàn)最多的前20個微衛(wèi)星重復(fù)類別為:CA, TG, GT, AC, GA, CT, TC, TA, AG, AT, TCCA, ATCC, TCTG, GATG, ATCT, CATC, TGGA, ATGG, GATA, GAG,占全部微衛(wèi)星序列的75.21%.在河豚基因組中未發(fā)現(xiàn)GC微衛(wèi)星序列的存在.與其它生物基因組中微衛(wèi)星分布特征相比,河豚基因組具有更高的簡潔性.本研究將為研究河豚微衛(wèi)星標(biāo)記、研究其群體遺傳多樣性,進行不同基因組的比較研究提供基礎(chǔ).
作 者： 崔建洲 申雪艷 楊官品 宮慶禮 顧謙群 CUI Jian-Zhou SHEN Xue-Yan YANG Guan-Pin GONG Qing-Li GU Qian-Qun 作者單位： 中國海洋大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)部,山東,青島,266003 刊 名： 中國海洋大學(xué)學(xué)報（自然科學(xué)版） ISTIC PKU 英文刊名： PERIODICAL OF OCEAN UNIVERSITY OF CHINA 年，卷(期)： 2006 36(2) 分類號： Q754 關(guān)鍵詞： 紅鰭東方鲀(Takifugu rubripes) 微衛(wèi)星 基因組【紅鰭東方鲀基因組微衛(wèi)星特征分析】相關(guān)文章：
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