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仿刺參的微衛(wèi)星標(biāo)記
為了評(píng)價(jià)種質(zhì)資源及基礎(chǔ)生物學(xué)研究的需要,本文開發(fā)了仿刺參的微衛(wèi)星標(biāo)記.NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中共有20個(gè)含有仿刺參微衛(wèi)星的序列,從中選取8個(gè)設(shè)計(jì)引物,發(fā)現(xiàn)6個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)有多態(tài)性.不同的引物獲得的等位基因數(shù)為3～9個(gè)不等,6個(gè)位點(diǎn)共獲得了31個(gè)等位基因,每個(gè)位點(diǎn)平均獲得5.2個(gè)等位基因.6個(gè)位點(diǎn)的平均觀測(cè)雜合度(Ho)為0.3611,平均期望雜合度(He)為0.6402.位點(diǎn)AJMS004提供的多態(tài)性信息含量值較低,為0.4862;其他5個(gè)位點(diǎn)均在0.5以上.另外,還嘗試了紅海參(Parastichopus californicus)微衛(wèi)星標(biāo)記在仿刺參的通用性.實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,在較高的退火溫度下,5對(duì)引物均能擴(kuò)增仿刺參的基因組DNA并具多態(tài)性.5個(gè)位點(diǎn)共獲得了22個(gè)等位基因,每個(gè)位點(diǎn)平均獲得4.4個(gè)等位基因.5個(gè)位點(diǎn)的平均觀測(cè)雜合度(Ho)為0.1733,平均期望雜合度(He)為0.4201.其中位點(diǎn)Psc 2的多態(tài)性信息含量值最高,為0.8500.
作 者： 戰(zhàn)愛斌 包振民 陸維 汪小龍 胡景杰 ZHAN Ai-bin BAO Zhen-min LU Wei WANG Xiao-long HU Jing-jie 作者單位： 戰(zhàn)愛斌,ZHAN Ai-bin(中國(guó)海洋大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)部海洋生物遺傳與種質(zhì)工程實(shí)驗(yàn)室,山東,青島,266003;中國(guó)海洋大學(xué)海水養(yǎng)殖教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,山東,青島,266003)包振民,陸維,汪小龍,胡景杰,BAO Zhen-min,LU Wei,WANG Xiao-long,HU Jing-jie(中國(guó)海洋大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)部海洋生物遺傳與種質(zhì)工程實(shí)驗(yàn)室,山東,青島,266003)
刊 名： 水產(chǎn)學(xué)報(bào) ISTIC PKU 英文刊名： JOURNAL OF FISHERIES OF CHINA 年，卷(期)： 2006 30(2) 分類號(hào)： S917 關(guān)鍵詞： 仿刺參 微衛(wèi)星標(biāo)記 多態(tài)性 通用性【仿刺參的微衛(wèi)星標(biāo)記】相關(guān)文章：
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